齊秦過去與王祖賢的17年複雜感情、在當時轟動整個娛樂圈，在1日播出的《誰是大歌神》中，他回顧自己長達17年的愛情故事時，雖然並未提到對方名字，但現場所有人都知道該名女孩就是王祖賢，他除了坦言至今仍會探望王祖賢家人，還得知對方現在有段不錯的感情，間接爆出女方目前疑似有了新戀情。
王祖賢2002年拍完徐楓的電影《美麗上海》後，因情感糾紛淡出演藝圈，隱居加拿大，躲開娛樂圈喧擾，過往演藝圈友人也找不到她，據悉她在加拿大重返校園，在1間國際語言學校讀書，雖然她不在江湖，江湖上卻依然有她傳說，在她隱居後，除了她復出的訊息屢傳不止外。
早在2012年4月22日，網友釋出三張王祖賢於當天在溫哥華漁人碼頭遊玩時所拍攝的照片。王祖賢生日時候通過姊妹的微博釋出一張於2011年底自己的照片，來感謝一直關心她支援她的影迷和朋友們。相片中的王祖賢風采不減當年，面板氣色十分年輕，歲月似乎沒在她臉上留下痕跡。
在國中畢業後，王祖賢利用《今夜湖畔會很冷》開始展露頭角，劉德華曾說：“最為理想的情人，應該是關之琳、王祖賢、林青霞和鐘楚紅四人的混合體。”王祖賢曾經公開對外坦言，劉德華是她很喜歡的那一型別的男人，只是，劉德華身邊已有“傳聞中的女友”，自己只得“知難而退”。她自怨自艾地嘆道：劉德華是她惟一想追而沒有追上的男人。
1985年，王祖賢因為與許冠傑合作電影《打工皇帝》、《衛斯理傳奇》兩部影片，期間傳出二人擦出火花，陷入三角戀之中，更有傳聞指出許冠傑為贏得王祖賢芳心，曾以金色保時捷贈佳人。當時正處許冠傑在演藝圈的輝煌時代，也為王祖賢的名氣和事業打下很好的基礎。
1986年，王祖賢的名字又與爾冬升扯在了一起，當年曾有人目擊了二人在娛樂場所消遣時關係愛昧，此後又多次與爾冬升在公開場合如影隨形，於是一度傳出了兩人在拍拖。而王祖賢對此解釋為：對爾冬升也的確有好感，不過只是把爾冬升當普通朋友交往，兩人不可能走到一起。
當年王祖賢是憑藉電影《倩女幽魂》一舉成名的，然而就在拍攝相關係列片集時，媒體爆出王祖賢與梁朝偉的拍拖的緋聞，當時的梁朝偉已開始與劉嘉玲戀愛。但是媒體還是以真憑實據的報道指出，當時梁朝偉為表示自己對王祖賢的真心實意，曾經與劉嘉玲鄭重提出過分手。劉嘉玲為此還大鬧樑府。
1987年，黎明初入娛樂圈拜戴思聰為師，而王祖賢的媽媽是戴家的常客，王媽媽對黎明很有好感，索性收了黎明為乾兒子，創造機會讓王祖賢與黎明接觸。再加二人共同的朋友林俊賢在中間的撮合，王祖賢與黎明很快拍拖，二人甚至被爆出同居的訊息。後來王祖賢事業亦開始順利發展，名氣大增，二人見面少了，感情也由濃轉淡。
真正奪得伊人芳心的是男主角齊秦，她說：“初見面時沒太多感覺，心裡只是想我和他差不多高，相處下來覺得他不但有才華，而且對我很照顧和細心，我們很合得來。”
齊秦對王祖賢很傾心，一次他喝醉了酒，王祖賢要離開時，他就藉著酒勁吻了她。齊秦說：“這在平時是肯定不敢的，原來以為她會躲開，沒想到她也抱住了我，兩個人就這樣吻在一起。12月，王祖賢與齊秦的戀情曝光，雙方也大方地公開證實。
兩人相戀3年後，王祖賢遇到了豪門公子林建嶽，他老爸是富豪級別的電視臺幕後老闆，與事業剛剛起步的齊秦相比，林公子是為財大氣粗又有權有勢的豪門少爺。並且很會討女人歡心的林公子更送上千萬豪宅。“以前他有太太，我不想做第三者，也不願意破壞別人的家庭，直到他辦了分居手續，大家才開始交往。”王祖賢這樣描述他們的交往。
據稱，林建嶽對王祖賢發起了猛攻的追求，由於王祖賢是一個比較高傲的人，所以還一度地當眾表示很討厭林建嶽，並稱不想介入別人的家庭，不考慮與已婚男士談戀愛。林建嶽不生氣，反而追得更加激烈。林建嶽追了3年，為了向美人表達自己是真心的，正式宣佈要與妻子離婚。
一九九三年王祖賢公開與林建嶽的戀情，受到強大的壓力，林母的一句話非常惡毒：“我當我兒子去叫雞。”飽經考驗的感情到底沒能開花結果，一九九五年九月，王祖賢賣掉林送給她的半山香閨，隻身赴溫哥華療傷，提及這段感情，她當眾淚流滿面：“不管對錯，我嘗試了，不管是不是我應該得到的，我也接受。”
二人分手後，林建嶽對王祖賢仍舊情綿綿的承認：“我們仍然是朋友，每次我去加拿大，都會通電話，我覺得永遠都是朋友，做不成夫妻，做不成男女朋友，都是好朋友，要不然，不會一起這麼多年。”
當年齊秦在聽到王祖賢與林建嶽的緋聞時，幾乎是傷心欲絕的痛苦，齊秦無法相信心高氣傲的王祖賢，竟然會毅然的投入林建嶽的懷抱。曾打電話親自向王祖賢確認。而後在王祖賢與林建嶽糾葛不清的歲月裡，齊秦創作了諸如《無情的雨，無情的你》等傷懷情歌。
與此同時，王祖賢還曾在1992年因拍攝《城市獵人》一度與成龍傳出緋聞。或許王祖賢最大的悲就是在感情上太過於認真，特別是與成龍，明知道對方就是抱著玩的心態，還一往情深。
那段時間，遠在加拿大的王祖賢聲名掃地，輿論一片指責，星運也從此一落千丈，在聽到《無情的雨，無情的你》之後給齊秦打了電話，齊秦談及此事時曾經解釋說：“她和某人(林建嶽)的一段戀情讓她受了一身的傷，她給我打電話，問‘我們還能在一起嗎’。我們又重新和好。”
97年初的時候，齊秦和王祖賢突然出現在東京的羽田機場，這件事立即引起了新聞輿論的熱潮，齊秦並不忌諱說起自己與王祖賢分手的那段日子，他說自己度過了最難熬的時日，而後王祖賢歸來，兩人曾決心相守一生。
就在齊秦與王祖賢準備結婚前夕，突然殺出一個叫方美芳的女人，向傳媒公開她曾和齊秦同居多年，並有了一個十歲的兒子，經DNA查檢，果然是齊秦的骨肉。王祖賢雖然表面上對這件事並不在意，但還是導致兩人婚期一拖再拖，王祖賢在次奔赴加拿大。
而此後齊秦在回憶二人感情時說道，我們最後分手的原因，就是因為大家年紀也到了，緣分交錯的時間也已經夠多了，我們的關係中，親情已經大過了愛情。她也應該去尋找自己真正的理想，“我和小賢都是離異家庭長大的孩子，很渴望家庭的溫暖。小賢家裡壓力大，一家人都靠她養活，我沒能給她足夠的安全感。”
