臨床可用魚腥草鮮品煎服，或搗泥外敷，或入複方，或製成注射液供治療選用。對上呼吸道感染、急慢性支氣管炎、支氣管肺炎、大葉性肺炎及肺膿瘍等呼吸道感染，療效顯著；對五官科的化膿性炎症和面板科感染性炎症以及多種急性感染性疾病，也均有較好療效。
魚腥草的的作用
1、肺癰吐膿，肺熱咳嗽
本品寒能洩降，辛以散結，主入肺經，以清解肺熱見長，又具消癰排膿之效，故為治肺癰之要藥。用治痰熱壅肺，胸痛，咳吐膿血，常與桔梗、蘆根、瓜蔞等藥同用；若用治肺熱咳嗽，痰黃氣急，常與黃芩、貝母、知母等藥同用。
2、熱毒瘡毒
本品辛寒，既能清熱解毒，又能消癰排膿，亦為外癰瘡毒常用之品，常與野菊花、蒲公英、金銀花等同用；亦可單用鮮品搗爛外敷。
3、溼熱淋證
本品有清熱除溼、利水通淋之效，善清膀胱溼熱，常與車前草、白茅根、海金沙等藥同用，治療小便淋瀝澀痛。
此外本品又能清熱止痢，還可用治溼熱瀉痢。
魚腥草的現代研究
1、化學成分：本品含魚腥草素、揮發油、蕺菜鹼、槲皮苷、氯化鉀等。
2、藥理作用：魚腥草素對金黃色葡萄球菌、肺炎雙球菌、甲型鏈球菌、流感桿菌、卡他球菌、傷寒桿菌以及結核桿菌等多種革蘭氏陽性及陰性細菌，均有不同程度的抑制作用；其用乙醚提取的非揮發物，還有抗病毒作用。本品能增強白血球吞噬能力，提高機體免疫力，並有抗炎作用。所含槲皮素及鉀鹽能擴張腎動脈，增加腎動脈血流量，因而有較強的利尿作用。此外，還有鎮痛、止血、促進組織再生和傷口癒合以及鎮咳等作用。
